MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 7694

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012943	CGA	3	9	4045262	4045270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_012943	GCCC	2	8	4045309	4045316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7003	NC_012943	TCC	2	6	4045631	4045636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_012943	GTC	2	6	4045640	4045645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_012943	TCC	2	6	4045957	4045962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_012943	TCG	2	6	4045970	4045975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_012943	AACG	2	8	4045992	4045999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7008	NC_012943	TCC	2	6	4047565	4047570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7009	NC_012943	CA	3	6	4047661	4047666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7010	NC_012943	GTT	2	6	4047668	4047673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_012943	CCGG	2	8	4052680	4052687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_012943	GCCC	2	8	4053285	4053292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7013	NC_012943	CCG	2	6	4053309	4053314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_012943	CGA	2	6	4054444	4054449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_012943	CGCGC	2	10	4054472	4054481	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7016	NC_012943	CTA	2	6	4054502	4054507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_012943	AGGA	2	8	4057008	4057015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_012943	CGG	2	6	4057018	4057023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_012943	CAG	2	6	4057056	4057061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_012943	GAC	2	6	4057082	4057087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_012943	CAC	2	6	4057090	4057095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_012943	ATC	2	6	4057096	4057101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_012943	GAC	2	6	4057103	4057108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_012943	CGA	2	6	4057111	4057116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_012943	CTG	2	6	4057136	4057141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_012943	GGC	2	6	4060802	4060807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_012943	CG	3	6	4060808	4060813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_012943	CCGT	2	8	4060821	4060828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7029	NC_012943	ACA	2	6	4060862	4060867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_012943	CAG	2	6	4060964	4060969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_012943	GAT	2	6	4060979	4060984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_012943	GGC	3	9	4061020	4061028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_012943	AGG	2	6	4061099	4061104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_012943	GT	3	6	4061553	4061558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_012943	CCG	2	6	4061602	4061607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_012943	GTG	2	6	4061624	4061629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_012943	GCA	2	6	4061630	4061635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_012943	GGT	2	6	4061698	4061703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_012943	GC	3	6	4061706	4061711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7040	NC_012943	ACTG	2	8	4061720	4061727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_012943	CATGC	2	10	4061731	4061740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7042	NC_012943	GCC	2	6	4061757	4061762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7043	NC_012943	CT	3	6	4063246	4063251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7044	NC_012943	TGA	2	6	4064173	4064178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_012943	GTG	2	6	4065205	4065210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_012943	TCG	2	6	4065227	4065232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_012943	CGG	2	6	4066467	4066472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_012943	GTGC	2	8	4066484	4066491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_012943	AC	3	6	4066500	4066505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_012943	CGA	2	6	4066506	4066511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_012943	CAA	2	6	4066549	4066554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_012943	ACCC	2	8	4066562	4066569	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7053	NC_012943	CGG	2	6	4066587	4066592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_012943	AGG	2	6	4066627	4066632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_012943	TGG	2	6	4067494	4067499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_012943	AGCAC	2	10	4067550	4067559	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7057	NC_012943	CAT	2	6	4067584	4067589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_012943	CCA	2	6	4067640	4067645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_012943	AGC	2	6	4067720	4067725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_012943	CCGGC	2	10	4067758	4067767	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7061	NC_012943	GGCG	2	8	4067806	4067813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_012943	CGT	2	6	4067864	4067869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_012943	GCC	2	6	4068083	4068088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_012943	GGC	2	6	4068149	4068154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_012943	GGC	2	6	4068180	4068185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_012943	GCCC	2	8	4068209	4068216	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7067	NC_012943	GCG	2	6	4068223	4068228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_012943	CGTT	2	8	4069481	4069488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7069	NC_012943	TCG	2	6	4069510	4069515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_012943	GGTA	2	8	4074023	4074030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_012943	GGGC	2	8	4074118	4074125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7072	NC_012943	TCG	2	6	4074202	4074207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_012943	CTC	2	6	4074231	4074236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7074	NC_012943	TCG	2	6	4074259	4074264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_012943	CTC	2	6	4074288	4074293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7076	NC_012943	TCG	2	6	4074316	4074321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_012943	AGCG	2	8	4074923	4074930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_012943	CGGCG	2	10	4074951	4074960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7079	NC_012943	GC	3	6	4074964	4074969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7080	NC_012943	TCT	2	6	4075266	4075271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_012943	GGTGC	2	10	4075273	4075282	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7082	NC_012943	GCC	2	6	4075313	4075318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_012943	CCGA	2	8	4075347	4075354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7084	NC_012943	GTC	3	9	4077850	4077858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_012943	GCCG	2	8	4077919	4077926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_012943	CGGG	2	8	4077933	4077940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7087	NC_012943	ACC	2	6	4078282	4078287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7088	NC_012943	CCG	2	6	4078314	4078319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_012943	ACC	2	6	4078352	4078357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_012943	GGT	2	6	4078373	4078378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_012943	CAC	2	6	4078384	4078389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_012943	GGCC	2	8	4078412	4078419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_012943	ACG	2	6	4078435	4078440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_012943	CGGG	2	8	4078444	4078451	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7095	NC_012943	ACC	2	6	4078506	4078511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7096	NC_012943	GC	3	6	4079682	4079687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_012943	CTGAA	2	10	4079747	4079756	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7098	NC_012943	GCC	2	6	4079774	4079779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7099	NC_012943	GAC	2	6	4079807	4079812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_012943	TCG	3	9	4079823	4079831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_012943	CAG	2	6	4079852	4079857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_012943	GGT	2	6	4079858	4079863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_012943	CGC	2	6	4079886	4079891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_012943	AGG	2	6	4079909	4079914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7107	NC_012943	CCG	2	6	4080069	4080074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7108	NC_012943	ACC	2	6	4081278	4081283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7109	NC_012943	CAC	2	6	4081322	4081327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_012943	TCG	2	6	4081370	4081375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_012943	ACG	2	6	4082033	4082038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_012943	CCG	3	9	4082842	4082850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_012943	CCA	2	6	4085904	4085909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_012943	CACC	3	12	4085927	4085938	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7115	NC_012943	GAC	2	6	4086077	4086082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_012943	GAC	2	6	4086104	4086109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_012943	G	7	7	4086118	4086124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_012943	AGG	2	6	4086125	4086130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_012943	GTC	2	6	4086136	4086141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_012943	G	6	6	4086155	4086160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_012943	ACA	2	6	4086287	4086292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_012943	GCCG	2	8	4086327	4086334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_012943	CGA	2	6	4087226	4087231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_012943	CA	3	6	4087239	4087244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7125	NC_012943	GAG	2	6	4087252	4087257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_012943	GCC	2	6	4087277	4087282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_012943	GCGG	2	8	4087296	4087303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7128	NC_012943	GCA	2	6	4087304	4087309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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